Thông tư này quy định vị trí, chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức và hoạt động của Hội đồng tư vấn cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh dược (sau đây gọi tắt là Hội đồng) cho các cơ sở kinh doanh thuốc phải kiểm soát đặc biệt, bao gồm:

- Cơ sở sản xuất, xuất khẩu, nhập khẩu, kinh doanh dịch vụ bảo quản thuốc gây nghiện, thuốc hướng thần, thuốc tiền chất, nguyên liệu làm thuốc là dược chất gây nghiện, dược chất hướng thần, tiền chất dùng làm thuốc, thuốc phóng xạ;

- Cơ sở sản xuất thuốc dạng phối hợp có chứa dược chất gây nghiện, thuốc dạng phối hợp có chứa dược chất hướng thần, thuốc dạng phối hợp có chứa tiền chất;

- Cơ sở bán buôn, bán lẻ thuốc gây nghiện, thuốc hướng thần, thuốc tiền chất, thuốc phóng xạ.

Hội đồng có chức năng tư vấn cho người đứng đầu cơ quan về việc cấp phép kinh doanh thuốc phải kiểm soát đặc biệt nêu trên. Nhiệm vụ của Hội đồng là xem xét, thẩm định và có ý kiến tư vấn bằng văn bản về hồ sơ đề nghị cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh dược. 
Hội đồng của Sở Y tế có ít nhất 3 thành viên, bảo đảm cơ cấu thành viên như sau:

- Chủ tịch Hội đồng là đại diện Sở Y tế;

- Thành viên Hội đồng là các cá nhân đại diện các cơ quan, tổ chức, đơn vị có liên quan;

- Thư ký Hội đồng

Hội đồng có thể hoạt động theo 02 phương thức là thông qua cuộc họp hoặc gửi xin ý kiến thành viên Hội đồng bằng Phiếu ghi ý kiến tư vấn theo Mẫu quy định.
Thông tư quy định tiêu chí của thành viên Hội đồng. Thông tư cũng quy định rõ, tất cả các thành viên trong hội đồng đều phải có cam kết không tham gia tư vấn đối với hồ sơ của cơ sở mà bản thân thành viên hoặc vợ, chồng, cha đẻ, cha nuôi, mẹ đẻ, mẹ nuôi, con đẻ, con nuôi, anh chị em ruột, anh rể, em rể, chị dâu, em dâu của thành viên làm việc hoặc góp vốn.